中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院國家醫(yī)學檢驗臨床醫(yī)學研究中心數(shù)據(jù)平臺采購項目招標項目的潛在供應商應在線上獲取招標文件,并于****年**月**日 **時**分（北京時間）前遞交投標文件。
國家醫(yī)學檢驗臨床醫(yī)學研究中心數(shù)據(jù)平臺技術參數(shù)（國產1套）
一、總體要求
1.本項目所建設醫(yī)學檢驗數(shù)智化協(xié)同創(chuàng)新平臺需按招標人要求部署在指定位置，包括多中心數(shù)據(jù)集成工具、數(shù)據(jù)治理工具、數(shù)據(jù)篩選工具、數(shù)據(jù)補錄等數(shù)據(jù)處理工具，同時部署統(tǒng)計學、機器學習等數(shù)據(jù)分析工具。支持檢驗中心和網絡成員**0人并發(fā)調用，為重大疾病及感染性疾病的自主創(chuàng)新檢驗標志物及檢驗技術的開發(fā)、檢驗項目參考區(qū)間建立技術及檢驗技術和產品的多中心臨床評價研究提供扎實的數(shù)據(jù)與工具支持；支持對圖像原文件進行集成接入，支持與數(shù)據(jù)庫內患者數(shù)據(jù)進行關聯(lián)，瀏覽，制備。
2.數(shù)據(jù)平臺支持臨床文本、影像數(shù)據(jù)的集成與查看，支持對文本與影像DICOM進行集成接入、tag結構化生產，并支持在數(shù)據(jù)庫應用層檢索、查看、制備；支持對圖像原文件進行集成接入，支持與數(shù)據(jù)庫內患者數(shù)據(jù)進行關聯(lián)、瀏覽及制備。
★3.本項目需要支持集成主流基于B/S架構的科研工具，實現(xiàn)科研需求與專業(yè)工具的高效對接（提供承諾函并加蓋投標人公章）。
4.投標人所提供的患者服務應用軟件必須符合《信息安全技術網絡安全等級保護基本要求》，并承諾配合招標人按照等級保護要求對軟件進行升級改造。
★5.實施期間，投標人應根據(jù)招標人需求對軟件功能進行升級改造服務（提供承諾函并加蓋投標人公章）。
★6.投標人應對該系統(tǒng)提供終身技術支持，配合本項目建設科室新流程需求和指標項目的新增與調整，所有費用納入到年維護費中，不再另行收費（提供承諾函并加蓋投標人公章）。
二、主中心數(shù)據(jù)采集治理平臺
1.自動化集成治理
1.1數(shù)據(jù)集成：通過數(shù)據(jù)庫同步技術和ETL等技術，對數(shù)據(jù)進行抽取、同步、匯集，實現(xiàn)對招標人單位多源異構數(shù)據(jù)的采集和匯聚。
1.2數(shù)據(jù)治理：標準化、體系化數(shù)據(jù)治理流程：患者脫敏、EMPI構建、數(shù)據(jù)清洗、比對、關聯(lián)、融合、數(shù)據(jù)質控管理等加工處理過程，對異構異源海量離散的數(shù)據(jù)資源加工生產，生成易于分析利用的、可共享的數(shù)據(jù)。
2.專病數(shù)據(jù)結構化生產
2.1專病數(shù)據(jù)模型建設：建立標準化、體系化數(shù)據(jù)治理流程，包含患者EMPI構建、數(shù)據(jù)清洗、比對、關聯(lián)、融合、數(shù)據(jù)質控管理等加工處理過程，對異構異源海量離散的數(shù)據(jù)資源加工生產，生成易于分析利用的、可共享的數(shù)據(jù)。
2.2數(shù)據(jù)架構化生產：基于深度學習技術的自由文本結構化引擎，根據(jù)專病數(shù)據(jù)模型對臨床數(shù)據(jù)進行結構化提取、標準化歸一化處理。
▲2.3支持對影像DICOM進行集成接入、tag結構化生產，支持在數(shù)據(jù)庫應用層檢索、查看、制備；支持對圖像原文件進行集成接入，支持與數(shù)據(jù)庫內患者數(shù)據(jù)進行關聯(lián)、瀏覽及制備（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.數(shù)據(jù)自動化更新
3.1數(shù)據(jù)增量集成：支持院內增量數(shù)據(jù)自動采集。
3.2數(shù)據(jù)增量治理：采集的數(shù)據(jù)自動進行標準化治理流程。
3.3數(shù)據(jù)增量結構化：治理后的數(shù)據(jù)按照疾病模型進行結構化處理。
3.4更新周期T+N：定期實現(xiàn)數(shù)據(jù)的增量更新，并對應用層數(shù)據(jù)同步更新。
三、分中心數(shù)據(jù)采集治理平臺
1.線下數(shù)據(jù)文件提供
▲1.1提供專病數(shù)據(jù)集需求調研、數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)集方案設計等服務，滿足對數(shù)據(jù)字段的個性化設計需求（提供承諾函并加蓋投標人公章）。
1.2提供數(shù)據(jù)表單配置服務，通過線上/線下會議討論形式、可視化數(shù)據(jù)表單配置形式進行字段集設計效果的確認。
1.3提供數(shù)據(jù)集上線后的字段變更修改服務。
1.4支持將分中心以線下積累的患者結構化數(shù)據(jù)（Excle格式）批量導入數(shù)據(jù)庫，并進行數(shù)據(jù)入庫的相關校驗與審核，對數(shù)據(jù)格式等進行修改，確保導入數(shù)據(jù)的準確性。
▲1.5支持患者檢查數(shù)據(jù)與影像圖像數(shù)據(jù)關聯(lián)處理（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
2.線上人工數(shù)據(jù)錄入
▲2.1分中心數(shù)據(jù)補錄：支持在產品頁面進行手動錄入的方式補充多中心的患者數(shù)據(jù)，擁有該功能權限的用戶登錄平臺后，能夠按需錄入分中心的患者數(shù)據(jù)，需要用戶按照主中心定義的結構化字段進行錄入（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
2.2分中心權限管理：分中心錄入員可以進行數(shù)據(jù)錄入、本單位錄入數(shù)據(jù)自由查看、創(chuàng)建新項目功能。
3.線上數(shù)據(jù)庫采集
形式同主中心，支持數(shù)據(jù)自動采集、治理、結構化生產、數(shù)據(jù)更新。
四、數(shù)據(jù)平臺應用層功能
1.數(shù)據(jù)資產
1.1匯交概覽：支持查看數(shù)據(jù)資產信息，各中心患者數(shù)量分布和數(shù)據(jù)時效概覽，綜合評價各中心數(shù)據(jù)質量。
1.2數(shù)據(jù)質控報告：數(shù)據(jù)接入報告、填充率報告、數(shù)據(jù)標準化報告。
1.3數(shù)據(jù)字典：疾病標準數(shù)據(jù)集，包括：指標名稱、指標說明、數(shù)據(jù)類型、提取規(guī)則、來源邏輯等內容，便于查閱和檢索。
2.科研數(shù)據(jù)中心
▲2.1靈感發(fā)現(xiàn)：支持主題管理；支持一鍵查看?；鶊D對應的搜索條件，實現(xiàn)快速召回和定位對應的患者人群，提高數(shù)據(jù)分析的效率；支持一鍵查看?；鶊D對應的搜索條件，實現(xiàn)快速召回和定位對應的患者人群，提高數(shù)據(jù)分析的效率（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.2數(shù)據(jù)駕駛艙：支持數(shù)據(jù)概覽、各科室數(shù)據(jù)概覽、庫內患者數(shù)量走勢，支持可視化分析（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.3檢索：支持多類型的搜索、支持智能病歷篩選、支持搜索病例的導出和分析（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.4患者全景：以時間軸形式查看患者診療全周期的數(shù)據(jù)，記錄患者在每一個時間節(jié)點的檢驗、檢查、診斷以及治療等數(shù)據(jù)，建立患者全景視圖；支持查看病歷原文，結構化數(shù)據(jù)及溯源信息（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.5多中心/單中心回顧性研究：支持患者納排、CRF表單設置、隨訪、數(shù)據(jù)核查、數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.6多中心/單中心前瞻性研究：支持患者納排、指標自動填充、數(shù)據(jù)預處理、統(tǒng)計分析（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.平臺管理
3.1權限管理：支持賬號、角色、數(shù)據(jù)、審批授權功能。
3.2中心管理：支持添加以及刪除參與機構。
3.3系統(tǒng)管理：支持系統(tǒng)管理、個人賬號管理、多中心管理、權限管理等內容。
五、數(shù)據(jù)分析工具
1.臨床數(shù)據(jù)處理
1.1變量處理：要求修改變量類型時，具有錯誤提示功能，方便修改類型；要求支持變量檢索，從而快速定位待處理變量；支持變量刪除。
1.2變量自定義：要求支持根據(jù)原變量，新建多種不同規(guī)則，生成新的分組變量；要求新的分組變量可進行有序變量定義，通過拖動即可保存變量順序；支持對數(shù)值型變量自動進行等寬離散化；支持對數(shù)值型變量自動進行等頻離散化；要求根據(jù)設置規(guī)則進行變量離散化情況預覽。
1.3離群值處理：要求智能選擇分析方法對多個數(shù)值型變量進行離群值分析；要求展示變量離群值詳情，離群值的界值；要求支持單個/批量變量離群值的處理；要求支持針對離群值分析結果和處理結果的保存。
1.4缺失值處理：要求支持變量的缺失值分析，并展示各個變量缺失率的情況；要求支持單個/批量變量缺失值的處理；要求支持查看單個變量缺失的樣本的數(shù)據(jù)填充率情況；要求支持缺失值分析結果和處理方式的保存。
1.5樣本處理：要求支持樣本數(shù)據(jù)的直接編輯；要求支持刪除樣本；要求支持將處理好的xlsx數(shù)據(jù)進行導出。
2.統(tǒng)計學分析
2.1描述性統(tǒng)計：要求根據(jù)變量類型自動計算出描述變量分布規(guī)律及數(shù)量特征分析的相關指標，如平均值、P**、P**、眾數(shù)、偏度、峰值、頻數(shù)、占比等；要求根據(jù)變量類型智能輸出箱式圖或餅狀圖；要求支持對圖片的顏色，字體，坐標軸進行設置，并能按照主題進行修改。
▲2.2顯著性分析：兩組或兩組以上獨立定性樣本顯著性分析；支持T檢驗，卡方檢驗，方差分析，非參數(shù)性檢驗（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.3ROC曲線：要求支持自動生成模型ROC曲線，并計算AUC值（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲2.4相關性分析：要求進行定量數(shù)據(jù)的相關性分析；要求支持Pearson、Spearman分析，并支持生成相關視圖（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
2.5一致性檢驗：支持Cohen's Kappa方法；Fleiss' Kappa方法；Kendall W協(xié)調系數(shù)；ICC組內相關系數(shù)；Bland-Altman法來進行多種診斷方法的一致性檢驗。
2.6邏輯回歸分析：要求支持分類數(shù)據(jù)的logistic回歸分析；要求支持模型似然比檢驗、平行性檢驗、二元logistic、有序分類logistic、多元logistic、模型預測準確率計算；要求提供列線圖。
2.7生存率分析：要求支持Kaplan Meier方法進行單因素生存分析；要求支持生成整體生存率和標準值；要求支持生成整體或分組生存率表；要求支持生成整體或分組的生存曲線。
2.8Cox比例風險回歸：要求支持生成Cox比例風險單因素分析或多因素分析結果；要求支持生成生存曲線；要求支持生成列線圖以及校準曲線；要求支持生成PI預后指數(shù)。
2.9多元回歸分析：要求根據(jù)變量類型智能進行單因素變量篩選；要求支持前進法；后退法；要求支持逐步回歸法進行多因素模型建立；要求支持生成殘差圖；要求支持各因素系數(shù)的結果展示。
▲2.**參考區(qū)間建立：支持根據(jù)醫(yī)學參考區(qū)間范圍的建立需要正態(tài)性轉換，計算各種定制的百分位數(shù)及置信區(qū)間；支持GAMLSS回歸建立連續(xù)性參考區(qū)間（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
2.**變異來源分析：多因素回歸分析可納入可能的變異來源變量進行線性擬合，通過各個變量的偏回歸系數(shù)，來探究檢驗分析物的變異因素；支持Z-test，確定變異來源，根據(jù)分析結果判斷是否需要分組。
3.機器學習
3.1配置因變量：要求支持用戶選擇任何的分類變量作為因變量進行分析。
3.2配置臨床變量：要求支持用戶靈活配置進入模型的臨床變量。
3.3配置組學特征濾波變換：要求支持用戶靈活配置建模所用組學特征所使用的濾波變換。
3.4配置組學特征類型：要求支持靈活配置建模所用組學特征的類別。
3.5配置模型驗證方法：要求支持以K折交叉驗證、指定測試集或者隨機拆分方法進行模型驗證；要求支持多次重復建模。
3.6特征清洗：要求支持刪除缺失值比例大于一定閾值的變量。
3.7特征相關性分析：要求支持移除某些變量，以緩解變量間的共線性問題。
3.8特征篩選：要求支持F-test、皮爾遜、互信息、L1正則、樹模型、循環(huán)特征刪除等6種及以上特征篩選方式。
3.9特征降維：要求支持**種及以上特征降維算法，包括相關性分析、PCA、各種特征篩選算法等。
▲3.**機器學習模型：要求支持Logistic Regression、SVM、Linear SVC、Decision Tree、Random Forest、Ada Boost、Gradient Boosting、XG Boost、Bernoulli NB、Gaussian NB、K Nearest Neighbors、Linear Discriminant Analysis、SGD、Multilayer Perceptron等**種及以上機器學習模型（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲3.**模型調參：要求支持手動配置模型參數(shù)；要求支持超參搜索，由系統(tǒng)選擇當前模型最優(yōu)參數(shù)（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
▲3.**全局超參搜索：要求支持系統(tǒng)搜索多種模型，以找出最優(yōu)的特征篩選算法、分類模型及其參數(shù)（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.**模型效果評價：要求支持自動計算模型準確率、精確率、靈敏度、特異度等。
3.**混淆矩陣：要求支持提供模型混淆矩陣結果。
3.**特征權重分析：要求支持自動排序參與建模的特征權重，提供每一特征的中英文解釋，并繪制特征權重圖。
3.** ROC曲線：要求支持自動生成模型ROC曲線，并計算AUC值。
▲3.** PR曲線：要求支持自動生成PR曲線，直觀展現(xiàn)不同閾值下模型精確度和召回率關系（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.**決策曲線：要求支持生成臨床決策曲線。
3.**校準曲線：要求支持生成校準曲線。
▲3.**諾模圖：要求支持在LR回歸模型的結構化報告中提供nomogram圖（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.**模型訓練日志：要求支持實時查看模型訓練過程記錄。
3.**數(shù)據(jù)下載：要求支持下載實驗分析數(shù)據(jù)和結果，包括ROC曲線、特征提取結果、訓練日志、樣本真實標簽和模型預測結果等。
3.**報告下載：要求支持下載實驗的結構化報告到本地，包括課題背景、實驗數(shù)據(jù)、模型參數(shù)、訓練過程、訓練結果的內容。
3.**模型下載：要求支持用戶下載訓練模型。
▲3.**外部驗證：要求支持對運行成功的模型進行外部驗證，并生成相關模型效果評價結果（根據(jù)參數(shù)描述要求提供系統(tǒng)截圖并加蓋投標人公章）。
3.**外部驗證結果下載：要求支持下載外部驗證結果。
★六、配置
| 軟件名稱 | 一級模塊 | 二級模塊 | 數(shù)量 | 單位 |
| 國家醫(yī)學檢驗臨床醫(yī)學研究中心數(shù)據(jù)平臺 | 主中心數(shù)據(jù)治理平臺 | 自動化集成治理 | 1 | 套 |
| 專病數(shù)據(jù)結構化生產 | ||||
| 數(shù)據(jù)自動化更新 | ||||
| 分中心數(shù)據(jù)采集治理平臺 | 線下數(shù)據(jù)文件提供 | |||
| 線上人工數(shù)據(jù)錄入 | ||||
| 線上數(shù)據(jù)庫采集 | ||||
| 數(shù)據(jù)平臺應用層功能 | 數(shù)據(jù)資產 | |||
| 科研數(shù)據(jù)中心 | ||||
| 平臺管理 | ||||
| 數(shù)據(jù)分析工具 | 臨床數(shù)據(jù)處理 | |||
| 統(tǒng)計學分析 | ||||
| 機器學習 |
七、售后服務
★1.本項目旨在建設一個面向六大類重大疾?。◥盒阅[瘤、代謝性疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、心腦血管疾病、自身免疫性疾病及感染性疾?。┘敖】等巳旱母哔|量檢驗數(shù)據(jù)平臺，覆蓋總樣本量至少5萬例。鑒于本平臺為長期科研基礎設施，后續(xù)將根據(jù)科研需求持續(xù)數(shù)據(jù)治理及數(shù)據(jù)分析工作，投標人項目進入質保期后配合甲方完成相關數(shù)據(jù)治理與數(shù)據(jù)分析需求。本項目軟件免費質保3年；提供7***小時技術支持服務（提供承諾函并加蓋投標人公章）。
2.投標人必須根據(jù)本次招標文件所制定的目標和范圍，提出相應的售后服務方案，并作為投標文件的一部分提交。
3.投標人必須做出培訓承諾，須提供免費的系統(tǒng)培訓，并詳細說明培訓計劃，通過培訓使用戶方能獨立操作、維護、管理，從而使用戶方能獨立進行管理、故障處理、日常測試維護等日常工作，確保系統(tǒng)能正常安全運行。
4.工期要求：合同簽訂之日起**個日歷日內完成軟件應用開發(fā)部署安裝調試及驗收。
5.投標人參與本項目的人員姓名、年齡、學歷、職責分工、專業(yè)技術培訓認證情況、曾參與類似項目所擔任的工作等，著重介紹擔任本項目的項目經理及各實施階段負責人情況。項目實施過程中，投標人應嚴格按照標書中的承諾將人員指派到位，其中項目經理和技術負責人必須專職全程參與本項目的開發(fā)、實施過程，未經招標人同意不得更換。須提供免費的系統(tǒng)培訓，并詳細說明培訓計劃，通過培訓使用戶方能獨立操作、維護、管理，從而使用戶方能獨立進行管理、故障處理、日常測試維護等日常工作，確保系統(tǒng)能正常安全運行。
6.在維保期內，基于招標人單位院內專家的臨床經驗，協(xié)助招標人單位共同進行科研方向與方案設計，并協(xié)助招標人單位臨床專家進行對應科研方向的相關文獻的查詢、數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析、AI算法建模等服務；協(xié)助招標人共同進行相關課題的聯(lián)合申報。
